国家卫健委功能性脑疾病诊治重点实验室成立于2019年，是重庆医科大学获批的首个国家卫生健康委重点实验室。实验室聚焦脑科学研究领域，围绕抑郁症和脑出血等重大脑疾病开展基础和临床研究。
实验室现设有电生理学平台、微生物平台、系统生物学平台、分子生物学平台、细胞生物学平台、病理形态学平台、动物行为学平台、生物信息数据分析平台，包括PacBio三代测序仪、Beckman Coulter流式细胞分选仪和分析仪、AXon膜片钳系统、Leica超高分辨激光扫描共聚焦显微镜系统、GS-MS/MS气相色谱质谱联用仪、高精度菌落检测分选系统、Olympus全玻片扫描系统、PerkinElmer多模式小动物活体成像系统、厌氧工作站、Leica全自动脱水机、包埋机、普通切片机、冷冻切片机和全自动免疫组化仪、多通道光纤记录系统等各种精密设备。
实验室先后承担国家重大科学研究计划（973计划）、国家重点研发计划、国家高技术研究发展计划（863计划）、国家自然科学基金国际合作等重点项目，获得纵向科研经费9000余万元。以通讯单位在新英格兰、柳叶刀等杂志上发表SCI论文412篇，单篇最高影响因子91.25分，SCI他引总次数15213次，单篇最高他引1360次。原创性科研成果先后获得国家科技进步二等奖、中华医学科技一等奖、重庆市自然科学一等奖、重庆市科技进步一等奖等奖项。
实验室拥有国家973首席科学家、中组部外专千人、中组部“万人计划”科技创新领军人才、国务院特殊津贴获得者、卫生部突出贡献中青年专家、中国医师协会神经内科医师分会三、四届会长、中华医学会神经病学分会四、五、六届副主任委员，青年长江学者、青年万人计划入选者、重庆市杰青、重庆英才·青年拔尖人才、重庆市中青年医学高端人才等完善的人才梯队。
