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重庆医科大学附属第一医院以优质学科资源为支撑，以专科协作为纽带，充分发挥重医附一院的辐射带动作用，形成补位发展模式，辐射带动区域内医疗服务能力提升，重点提升区域内重大疾病救治能力。自2015年以来，重庆医科大学附属第一医院已牵头成立39个专科联盟，来自全国22个省、直辖市、自治区共计900余家兄弟医院3000余个兄弟科室加入其中。
重庆医科大学附属第一医院专科联盟旨在搭建资源共享的专科联盟平台，建立规范化、同质化诊疗体系，加强专科间的交流协作，加强学科建设与人才培养，合作开展多中心临床研究，通过医教研三位一体帮扶，实现区域内优势互补、合作共赢，提升区域内的医疗服务能力和管理水平。
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01.重庆市呼吸学科建设联盟
牵头科室：呼吸内科 -
02.西部呼吸介入联盟
牵头科室：呼吸内科 -
03.重庆市VTE防治联盟
牵头科室：呼吸内科 -
04.重庆市耐药菌感染诊治联盟
牵头科室：感染科 -
05.重庆市感染与肝病专科联盟
牵头科室：感染科 -
06.成渝双城经济圈疑难重症诊疗专科联盟
牵头科室：感染科 -
07.重庆医科大学附属第一医院、重庆医科大学附属儿童医院国家临床重点专科围产医学专科联盟单位
牵头科室：产科 -
08.重庆市罕见遗传病产前诊断专科联盟
牵头科室：产科 -
09.重庆市心血管内科专科联盟
牵头科室：心血管内科 -
10.重庆市心脏康复中心联盟
牵头科室：心血管内科 -
11.重庆市老年护理联盟
牵头科室：老年科 -
12.重庆市老年医学联盟
牵头科室：老年科 -
13.重庆市重症医学专科联盟
牵头科室：重症医学科 -
14.重庆市内分泌糖尿病专科联盟
牵头科室：内分泌内科 -
15.西南眼科联盟
牵头科室：眼科 -
16.重庆市皮肤医学专科联盟
牵头科室：皮肤科 -
17.重庆市康复专科联盟
牵头科室：康复医学科 -
18.重庆市神经内科专科联盟
牵头科室：神经内科 -
19.两江精神医学专科联盟
牵头科室：精神科 -
20.重庆市临床药学专科联盟
牵头科室：药学部 -
21.重庆市麻醉与围手术期医学专科联盟
牵头科室：麻醉科
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