我科负责全院25个临床科室有关细菌感染、细菌耐药及抗生素使用方面的会诊（会诊量高达1万人次以上/年），及时对医院各科室出现的耐药菌指导其采取隔离措施及治疗手段，降低了感染病人死亡率及院内感染发生率、多重耐药菌发生率，有效控制了院内感染发生。我院CRE发病率明显低于其他地区。

抗生素研究室与传染病寄生虫病实验室拥有总价值500万元的大型精密仪器，主要包括：细菌学实验室、DNA和蛋白电泳系统、Western 印迹仪、凝胶图象分析系统、超声粉碎仪、荧光分光光度计、超速离心机、PCR仪等。菌种库保存了6千多株细菌，还拥有重庆市唯一的标准P2生物安全实验室，深入开展了多项多重耐药细菌的致病和耐药机制研究。

本亚专业病床35张，另外，我院的院感科主要成员皆由我科医生担任，对指导全院耐药菌的诊治和预防工作起到了很大作用。王其南教授自70年代初开始在中国开展抗感染药物的临床药理研究，感染病科1981年成为国家首批抗感染药理基地。本专业将细菌感染的临床-微生物检验-临床药理3者整合在一起，极大地提高了多重耐药菌感染的诊断准确率和治疗成功率。这种先进的抗感染治疗模式在国内处于领先水平。对四川、贵州、重庆等20余家医院感染科开展长期的医疗支援和帮扶建设。指导细菌监测、抗生素使用等。近年来学科作为主要单位主办、承办或参与包括国家继续教育、卫生部推广计划、中华医学会感染分会等达20次以上。